Bulundukları hayvanat bahçesinden kaçtıkları andan itibaren başları beladan kurtulmayan dört kafadarımız Alex, Melman, Gloria ve Mart, serinin üçüncü yapımında da New York'taki huzuru bulmak için yollara düşüyor.
Çıktıkları bu macerada yolları büyük bir sirk ile kesişen kahramanlarımız, burada hünerlerini sergilemenin yanı sıra başlarına geleceklerden de sıyrılmaları gerekiyor. Co-op multiplayer modlarıyla da dikkat çeken Madagascar 3'te seride karşımıza çıkan bir çok karakter yer aldığı gibi oynanışta dört farklı karakteri de yönlendirme şansını yakalayacağız. Ana senaryo dışında birçok mini oyuna da yer verilen Madagascar 3 ilesirk yaşamına adım atıyoruz.