Tomonobu Itagaki'nin ayrılışı sonrasında ana senaryoyu devam ettiren Team Ninja'nın yeni Ryu Hayabusa'nın macerası ilk çıkış notlarından birisini resmi Xbox dergisinden almış ve Ninja Gaiden III 8/10 puana layık görülmüştü.
Oyun incelemerinde saygın bir yere sahip olan IGN'in eleğinden geçen Ninja Gaiden 3, 3/10 alarak serinin hayranlarını şaşkına çevirdi. Son dönemde verdiği düşük puanlarla dikkat çeken site (Silent Hill: Downpour ve I am Alive) Ninja Gaiden 3'ü, verdiği puan göz önüne alındığında haliyle yerden yere vurdu.
Aksiyonu mahveden kamera açıları, Ryu Hayabusa modellemesi dışında düşük kalan görsellik, sadece tek bir silahın kullanıma sunulması; karakterde geliştirme ve yeni silahlar açma gibi özelliklerin yer almaması yanı sıra multiplayer modunun anlamsız olduğuna değinen editör, dönüp oynamak için ortada herhangi bir sebebin olmadığını belirtmiş. Özellikle oynanış, büyük eleştiri almış. Basitleştirilmiş, kendini tekrar eden ve tutkun bir oynanışa sahip olan oyunda ne serinin hayranları ne de yeni başlayacak olanlar için ilgi çekici hiçbir şey yer almıyormuş.