Shinsekai: Into the Depths'te oyuncular postapokaliptik, ürkütücü bir su altı dünyasında antik bir medeniyetin izlerini sürüyor. Bir yandan da deniz canavarlarıyla savaşıyor, denizaltı kullanıyor ve çok daha fazlasını yapıyorlar. Üstelik olaya daha da fazla özgünlük katmak için müzikler ve ses efektleri su altında kaydedildi.